關(guān)鍵詞:染色 脂蛋白 核酸蛋白質(zhì) 染色脂蛋白染色、核酸染色 醋酸纖維 瓊脂糖 聚丙烯酰胺電泳
染色方法詳詢—上海遠(yuǎn)慕生物
(以下方法介紹僅參考!注:本公司產(chǎn)品僅用于科研實(shí)驗(yàn)?。?/span>
經(jīng)醋酸纖維、瓊脂(糖)、聚丙烯酰胺電泳分離的各種生物分子需用染色法使其在支持物相應(yīng)位置上顯示出譜帶,從而檢測(cè)其純度、含量及生物活性。蛋白質(zhì)、糖蛋白、脂蛋白、核酸及酶等均有不同的染色方法,現(xiàn)分別介紹如下:
一、蛋白質(zhì)染色
染色液種類繁多,各種染色液染色原理不同,靈敏度各異。使用時(shí)可根據(jù)需要加以選擇。常用的染色液有:
1.氨基hei10B(amino black 10B又稱為amidoschwarz 10B或naphthalene blueblack,2B 200)氨基hei10B分子式為C22H13N6S3Na3,MW=715,λmax=620-630nm,是酸性染料。其磺酸基與蛋白質(zhì)反應(yīng)構(gòu)成復(fù)合鹽,是zui常用的蛋白質(zhì)染料之一,但對(duì)SDS-蛋白質(zhì)染色效果不好。另外,氨基hei10B染不同蛋白質(zhì)時(shí),著色度不等、色調(diào)不一(有藍(lán)、黑、棕等);作同一凝膠柱的掃描時(shí),誤差較大。
2.考馬斯亮藍(lán)R250(coomassie brilliant blue R250,簡(jiǎn)稱CBBR250或PAGE blue83)
考馬斯亮藍(lán)R250的分子式為C14H44O7H3S2Na,MW=824,λmax=560-590nm。染色靈敏度比氨基黑高5倍。該染料是通過(guò)范德瓦爾鍵與蛋白質(zhì)結(jié)合,尤其適用于SDS電泳微量蛋白質(zhì)染色,但蛋白質(zhì)濃度超過(guò)一定范圍時(shí),對(duì)高濃度蛋白質(zhì)染色不合乎Beer定律,作定量分析時(shí)要注意這點(diǎn)。
3.考馬斯亮藍(lán)G250(簡(jiǎn)稱CBBG250或PAGE blue G90,又名xylene brilliant cyanin G)
考馬斯亮藍(lán)G250比CBB R250多二個(gè)甲基。MW=854,λmax=590-610nm。染色靈敏度不如R250,但比氨基黑高3倍。其優(yōu)點(diǎn)是在三lv乙酸中不溶而成膠體,能選擇地使蛋白質(zhì)染色而幾乎無(wú)本底色,所以常用于重復(fù)性好和穩(wěn)定的染色,適于作定量分析。
4.銀染色法
此法是Switzer.R.C和Merril.CR首先提出的,它較CBB R250靈敏100倍。但染色機(jī)制
尚不清楚,可能與攝影過(guò)程Ag+的還原相似。其靈敏度很高,牛血清為4×10-5μg/mm2,即清蛋白為8×10-5μg/mm2,cyt C為1.7×10-4μg/mm2,因此也常用于凝膠電泳蛋白質(zhì)染色。
二、脂蛋白染色
1.油紅O(oil red)染色
將凝膠先置于平皿中,用5%乙酸固定20min,用H2O漂洗吹干后,再用油紅O應(yīng)用液染色18h,在乙醇∶水=5∶3中浸洗5min,zui后用蒸餾水洗去底色。必要時(shí)可用氨基黑復(fù)染,以證明是脂蛋白區(qū)帶。
2.蘇丹heiB(sudan black B)
將2g蘇丹heiB加60ml吡啶和40ml醋酸酐、混合,放置過(guò)夜。再加3000ml蒸餾水,乙酰蘇丹黑即析出。抽濾后再溶于丙酮中,將丙酮蒸發(fā),剩下粉狀物即乙酰蘇丹黑。將乙酰蘇丹黑溶于無(wú)水乙醇中,使呈飽和溶液。用前過(guò)濾。按樣品總體積1/10量加入乙酰蘇丹黑飽和液將脂蛋白預(yù)染后進(jìn)行電泳。此染色適用于瓊脂糖電泳及PAGE脂蛋白的預(yù)染。
三、核酸的染色
核酸染色法一般可將凝膠先用三lv乙酸、甲酸—乙酸混合液、lv化高汞、乙酸、乙酸鑭等固定,或者將有關(guān)染料與上述溶液配在一起,同時(shí)固定與染色。有的染色液同時(shí)染DNA及RNA,如stains-all、溴乙錠、掊花青-鉻礬法等,也有RNA、DNA各自特殊的染色法。
1.RNA染色法
(1)熒光染料溴乙錠(ethidium bromide簡(jiǎn)稱EB):可用于觀察瓊脂糖電泳中的RNA、DNA帶。EB能插入核酸分子中堿基對(duì)之間,導(dǎo)致EB與核酸結(jié)合。超螺旋DNA與EB結(jié)合能力小于雙鏈開環(huán)DNA,而雙鏈開環(huán)DNA與EB結(jié)合能力又小于線性DNA,可在紫外分析燈(253nm)下觀察熒光。如將已染色的凝膠浸泡在1mmol/L MgSO4溶液中1h,可能降低未結(jié)合的EB引起的背景熒光,對(duì)檢測(cè)極少量的DNA有利。EB染料具有下列優(yōu)點(diǎn):操作簡(jiǎn)單,凝膠可用1-0.5μg/ml的EB染色,染色時(shí)間取決于凝膠濃度,低于1%瓊脂糖的凝膠、染15min即可。多余的EB不干擾在紫外燈下檢測(cè)熒光;染色后不會(huì)使核酸斷裂,而其他染料做不到這點(diǎn),因此可將染料直接加到核酸樣品下,以便隨時(shí)用紫外燈追蹤檢查;靈敏度高,對(duì)1ng RNA、DNA均可顯色。EB染料是一種強(qiáng)烈的誘變劑,操作時(shí)應(yīng)注意防護(hù),應(yīng)戴上聚乙烯手套。
(2)焦寧Y(pyronine Y):此染色料對(duì)RNA染色效果好,靈敏度高。TMV-RNA在2.5%PAAG,直徑為0.5cm的凝膠柱中檢出的靈敏度為0.5μg;若選擇更合適的PAAG濃度,檢出靈敏度可提高到0.01μg;脫色后凝膠本底顏色淺而RNA色帶穩(wěn)定,抗光且不易退色。
2.DNA染色法
除了用EB染色外,還有以下幾種方法:
(1)甲基綠(methyl grenn):一般將0.25%甲基綠溶于0.2mol/L pH4.1的乙酸緩沖液中,用lv仿抽提至無(wú)紫色,將含DNA的凝膠浸入,室溫下染色1h即可顯色,此法適用于檢測(cè)天然DNA。
(2)二苯胺(diphenylamine):DNA中的α—脫氧核糖在酸性環(huán)境中與二苯胺試劑染色1h,再在沸水浴中加熱10min即可顯示藍(lán)色區(qū)帶。此法可區(qū)別DNA和RNA。