一. 常用貯液與溶液
1mol/L亞精胺(Spermidine): 溶解2.55g亞精胺于足量的水中,使終體積為10ml。分裝成小份貯存于-20℃。
1mol/L精胺(Spermine):溶解3.48g精胺于足量的水中,使終體積為10ml。分裝成小份貯存于-20℃。
10mol/L乙酸胺(ammonium acetate):將77.1g乙酸胺溶解于水中,加水定容至1L后,用0.22um孔徑的濾膜過濾除菌。
10mg/ml牛血清蛋白(BSA):加100mg的牛血清蛋白(組分V或分子生物學(xué)試劑級,無DNA酶)于9.5ml水中(為減少變性, 須將蛋白加入水中,而不是將水加入蛋白),蓋好蓋后,輕輕搖動,直至牛血清蛋白完/全溶解為止。不要渦旋混合。加水定容到10ml,然后分裝成小份貯存于-20℃。
1mol/L二硫蘇糖醇(DTT):在二硫蘇糖醇5g的原裝瓶中加32.4ml水,分成小份貯存于-20℃?;蜣D(zhuǎn)移100mg的二硫蘇糖醇 至微量離心管,加0.65ml的水配制成1mol/L二硫蘇糖醇溶液。
8mol/L乙酸鉀(potassium acetate):溶解78.5g乙酸鉀于足量的水中,加水定容到100ml。
1mol/L氯/化鉀(KCl):溶解7.46g氯/化鉀于足量的水中,加水定容到100ml。
3mol/L乙酸鈉(sodium acetate):溶解40.8g的三水乙酸鈉于約90ml水中,用冰乙酸調(diào)溶液的pH至5.2,再加水定容到100ml。
0.5mol/L EDTA:配制等摩爾的Na2EDTA和NaOH溶液(0.5mol/L),混合后形成EDTA的三鈉鹽?;蚍Q取186.1g的Na2EDTA•2H2O和20g的NaOH,并溶于水中,定容至1L。
1mol/L HEPES:將23.8gHEPES溶于約90ml的水中,用NaOH調(diào)pH(6.8-8.2),然后用水定容至100ml。
1mol/L HCl:加8.6ml的濃鹽酸至91.4ml的水中。
25mg/ml IPGT:溶解250mg的IPGT(異丙基硫代-β-D-半乳糖苷)于10ml水中,分成小份貯存于-20℃。
1mol/LMgCl2:溶解20.3g MgCl2•6H2O于足量的水中,定容到100ml。
100mmol/L PMSF:溶解174mg的PMSF(苯甲基/磺酰氟)于足量的異丙醇中,定容到10ml。分成小份并用鋁箔將裝液管包裹 或貯存于-20℃。
20mg/ml蛋白酶K(proteinase K):將200mg的蛋白酶L加入到9.5ml水中,輕輕搖動,直至蛋白酶K完/全溶解。不要渦旋混合。加水定容到10ml,然后分裝成小份貯存于-20℃。
10mg/mlRnase(無DNase)(DNase-free RNase):溶解10mg的胰蛋白RNA酶于1ml的10mmol/L的乙酸鈉水溶液中(pH 5.0)。溶解后于水浴中煮沸15min,使DNA酶失活。用1mol/L的Tris-HCl調(diào)pH至7.5,于-20℃貯存。(配制過程中要戴手套)
5mol/L氯化鈉(NaCl):溶解29.2g氯化鈉于足量的水中,定容至100ml。
10N氫氧化鈉(NaOH):溶解400g氫氧化鈉顆粒于約0.9L水的燒杯中(磁力攪拌器攪拌),氫氧化鈉完/全溶解后用水定容至1L。
10%SDS(十二烷基硫酸鈉):稱取100gSDS慢慢轉(zhuǎn)移到約含0.9L的水的燒杯中,用磁力攪拌器攪拌直至完/全溶解。用水定容至1L。
2mol/L山梨(糖)醇(Sorbitol):溶解36.4g山梨(糖)醇于足量水中使終體積為100ml。
100%三氯/乙酸(TCA):在裝有500gTCA的試劑瓶中加入100ml水,用磁力攪拌器攪拌直至完/全溶解。(稀釋液應(yīng)在臨用前配制)
2.5% X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳糖苷):溶解25mg的X-gal于1ml的二甲基甲酰胺(DMF),用鋁箔包裹裝液管,貯存于-20℃。
100×Denhardt試劑(Denhardt’s regent) 成分及終濃度 配制100ml溶液各成分的用量
2%聚蔗糖(Ficoll,400型) 2%聚乙烯吡咯烷酮(PVP-40) 2%BSA(組分V)
水 2g 2g 2g
加水至總體積為100ml ,依照上表稱取各組分,溶于水中定容。過濾除菌及雜質(zhì),分裝成小份于-20℃貯存。
10×標(biāo)準(zhǔn)DNA連接酶緩沖液(standard DNA ligase buffer)(粘端、平端連接) 成分及終濃度 配制10ml溶液各成分的用量 0.5mol/L Tris-HCl:5ml1mol/L 貯液 ,100mmol/L MgCl2:1ml 1mol/L 貯液,100mmol/L DTT:1ml 1mol/L 貯液,2mmol/L ATP: 200ul 100 mmol/L 貯液,5mmol/L 鹽酸亞精胺(可選):50ul 1 mmol/L 貯液,0.5mg/ml BSA(組分V)(可選):0.5ml 10 mg/mL 貯液 ,水: 2.25ml
將配制好的緩沖液分裝成小份,貯存于-20℃ 。
100 mmol/L dNTP 溶液(dNTP solutions) 可以購買到100mmol/L純dNTPs貯液,-80℃可貯存至少6個月。
10mmol/L dNTP混合液 成分及終濃度 配制20ul溶液各成分的用量
10mmol/L dATP
10mmol/L dCTP
10mmol/L dGTP
10mmol/L dTTP
水 2ul 100 mmol/L dATP 貯液
2ul 100 mmol/L dCTP 貯液
2ul 100 mmol/L dGTP 貯液
2ul 100 mmol/L dTTP 貯液
12ul
20%PEG 8000/2.5M NaCl
成分及終濃度 配制10ml溶液各成分的用量
質(zhì)量濃度為20%聚乙二醇
2.5mol/L 氯化鈉
水 20g
50ml 5 mol/L 氯化鈉 或 14.6g 固體氯化鈉
補足100ml
加聚乙二醇于含有氯化鈉的燒杯中,加水至終體積100ml,用磁力攪拌器攪拌溶解。
20×SSC
成分及終濃度 配制1L溶液各成分的用量
300mmol/L 檸檬酸三鈉(二水)
3mol/L 氯化鈉
水 88.2g
175.3g
補足1L
溶解檸檬酸三鈉(二水)和氯化鈉于約0.9L水中,加幾滴10N NaOH溶液調(diào)pH為7.0,用水補足體積至1L。
DEPC(焦碳酸二乙酯)處理水
加100ul DEPC 于 100ml 水中,使DEPC的體積分數(shù)為0.1%。在37℃溫浴至少12h,然后在15 psi 條件下高壓滅菌20min,以使殘余的DEPC失活。DEPC會與胺起反應(yīng),不可用DEPC處理Tris緩沖液。
甲酰胺(deionized formamide)
直接購買或加Dowex XG8 混合樹脂于裝有甲酰胺的玻璃燒杯中,用磁力攪拌器輕輕攪拌1h,可去除甲酰胺中的離子。經(jīng)Whatman 1號濾紙過濾除去樹脂后分成小份,充氮氣于-80℃貯存(防止氧化)。
磷酸緩沖液(phosphate buffer)
按照下表所給定的體積,混合1 mol/L 的磷酸/二氫鈉(單堿)和1mol/L 磷酸/氫二鈉(雙堿)貯液,獲得所需pH的磷酸緩沖液。配制1 mol/L 的磷酸/二氫鈉(NaH2PO4•H2O)貯液:溶解138g于足量水中,使終體積為1L;1mol/L 磷酸氫/二鈉(Na2HPO4)貯液:溶解142g于足量水中使終體積為1L。
1mol/L 磷酸/二氫鈉(ml) 1mol/L 磷酸/氫二鈉(ml) 最終pH值
TE(用于懸浮和貯存DNA)
成分及終濃度 配制100ml溶液各成分的用量
10mmol/L Tris-HCl
1mmol/L EDTA
水 1ml 1mol/L Tris-HCl(pH7.4-8.0,25℃)
200ul 0.5 mol/L EDTA(pH 8.0)
98.8ml
Tris緩沖液(Tris-HCl buffer)
將121g的Tris堿溶解于約0.9L水中,再根據(jù)所要求的pH(25℃下)加一定量的濃鹽酸(11.6N),用水調(diào)整終體積至1L。
濃鹽酸的體積(ml) pH