質(zhì)粒提不出和得率較低的原因
1 ) 大腸桿菌老化:
請涂布平板培養(yǎng)后,重新挑選新菌落進行液體培養(yǎng)。
2 ) 質(zhì)??截悢?shù)低:
由于使用低拷貝數(shù)載體引起的質(zhì)粒DNA 提取量低,可更換具有相同功能的高拷貝數(shù)載體 。
3 ) 菌體中無質(zhì)粒:
有些質(zhì)粒本身不能在某些菌種中穩(wěn)定存在,經(jīng)多次轉接后有可能造成質(zhì)粒丟失。例如,柯斯質(zhì)粒在大腸桿菌中長期保存不穩(wěn)定,因此,不要頻繁轉接,每次接種時應接種單菌落,另外,檢查篩選用抗生素使用濃度是否正確。
4 ) 堿裂解不充分:
使用過多菌體培養(yǎng)液,會導致菌體裂解不充分。
5 ) 吸附柱過載:
不同產(chǎn)品中吸附柱吸附能力不同,如果需要提取的質(zhì)粒量很大,請分多次提取。
6 ) 質(zhì)粒未全部溶解(尤其質(zhì)粒較大時):
洗脫溶解質(zhì)粒時,可適當加溫或延長溶解時間。
7 ) 乙醇殘留:
漂洗液洗滌后應離心盡量去除殘留液體,樹脂型試劑盒漂洗后應晾干樹脂,再加入洗脫緩沖液。
8 ) 洗脫液加入位置不正確:
洗脫液應加在硅膠膜中心部位以確保洗脫液會wan全覆蓋硅膠膜的表面達到最大洗脫效率。
9 ) 洗脫液不合適:
DNA只在低鹽溶液中才能被洗脫,如,洗脫緩沖液EB(10mM Tris•Cl,pH8.5)或水。洗脫效率取決于pH值。最大洗脫效率在pH7.0~8.5間。當用水洗脫時確保其pH值在此范圍內(nèi),如果pH過低可能導致洗脫量低。洗脫時將滅菌蒸餾水或洗脫緩沖液加熱至60℃后使用有利于提高洗脫效率。